尹坤
生物学专业：硕士生导师
个人简介：
伟德app介绍特聘副研究员，2023年于厦门大学化学化工学院获得博士学位，2024年于上海交通大学医学院从事博士后研究工作，2026年入职伟德app介绍。 研究工作主要基于微流控技术，致力于单分子和单细胞时空组学分析相关研究。迄今为止，以第一或通讯作者（含共同）发表 PNAS, Nat. Commun., Angew. Chem. Int. Ed, Anal. Chem., Small Methods, Nano Today等 SCI 论文十余篇，授权专利3项。目前，已获得国家自然科学基金青年基金 C 类，博后特别资助，博后面上项目，国家资助博士后研究人员计划 C 类，上海市超级博士后激励计划等项目支持。获得福建省科技进步奖三等奖（排名第五），福建省优秀博士毕业论文，全国化工设计大赛二等奖等荣誉。开发的单细胞转录组测序技术（Well-Paired-Seq）成功被产业化，已经服务全国 100 多个课题组，实现了100多种组织类型检测。
科研项目：
1. 国家自然科学基金青年基金C 类，2025-2027，30万
2. 伟德app介绍未来学科“前沿探索与交叉创新”项目，2026-2028，15万
3. 博后特别资助，2024-2026，18万
4. 博后面上项目，2024-2026，8万
5. 国家资助博士后研究人员计划C 类，2024-2026，24万
6.上海市超级博士后激励计划，2024-2026，30 万
研究方向：
面向生命科学与生物医药领域对高通量、高分辨率和动态分子检测的需求，融合微流控、核酸编码、代谢标记及多组学测序技术，开展单细胞与空间组学分析新方法及其生物医学应用研究，重点发展以下三个方向：
（1）单细胞组学分析：开发高通量、高灵敏度的单细胞多组学测序技术，结合代谢标记与分子编码策略，实现单细胞基因表达及RNA合成、降解等动态过程的定量解析，揭示细胞异质性与状态转变的分子调控机制。
（2）空间组学分析：发展高分辨率空间转录组与时空多组学检测技术，实现组织原位基因表达、分子动态及多模态信息的联合分析，研究复杂组织中细胞空间组织、相互作用及动态调控规律。
（3）微流控技术开发：设计高通量微液滴、微孔阵列及集成化微流控芯片，构建适用于单细胞操控、核酸编码、分子反应与多组学检测的分析平台，推动新型组学技术的标准化与应用转化。
科研论文：
1. Yin K.#, Qin Y.#, Cheng R.#, Zhang W.#, Zhang S., Liu P., Li M., Xu Y., Cao J., Zhao M., Wu L., Song J.*, Lin S.*, Yang C.*, DynaST-seq: A Spatio-Temporal Transcriptomic Approach for Resolving Gene Expression Dynamics in Tissues. Sci. Adv., 2026, In Revision.
2. Zhang S.#, Xu Y.#, Cheng R.#, Zheng Z.#, Song J.*, Yin K.*, Yang C.*, Kinetics-seq enables comprehensive profiling of single-cell RNA kinetics in vivo to reveal dynamic tumor heterogeneity. PNAS, 2026, 123, e2534052123
3. Yin K., Lin S.*, Yang C.*, Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing. Acc. Chem. Res., 2026,59, 6, 1056-1069
4. Yin K.#, Xu Y.#, Guo Y.#, Zheng Z.#, Lin X., Zhao M., Dong H., Liang D., Zhu Z., Zheng J.*, Lin S.*, Song., J.*, Yang C.*, Dyna-vivo-seq unveils cellular RNA dynamics during acute kidney injury via in vivo metabolic RNA labeling-based scRNA-seq. Nat. Commun., 2024, 15,9866.
5. Lin, S.#, Yin, K.#, Zhang Y.#, Lin F.#, Chen X., Zeng X., Guo X., Zhang H., Song J.*, Yang C.*, Well-TEMP-seq as a microwell-based strategy for massively parallel characterizing the temporal dynamics of single-cell gene expression. Nat. Commun., 2023, 14, 272.
6. Wang S.#, Yin K.#, Song J., Lin S.*, Yang C.*, Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics. Angew. Chem. Int. Ed., 2025,e202510939.
7. Yin K.#, Zhao M.#, Xu Y.#, Zheng Z.#, Huang S., Liang D., Dong H., Guo Y., Lin L., Song J., Zhang H., Zheng J.*, Zhu Z.*, Yang C.*, Well-Paired-Seq2: High-Throughput and High-Sensitivity Strategy for Characterizing Low RNA-Content Cell/Nucleus Transcriptomes. Anal. Chem., 2024, 96, 6301-6310.
8. Yin K., Huang S., Ruan W., Wei H., Dong H., Liang D., Zhao M., Qi W., Yang C., Zhu Z.*, Integrated Single-tube Operation for Rapid and Uniform Single-Cell Whole-Genome Sequencing. Nano Today, 2023,101807
9. Yin K.#, Zhao M.#, Lin L.#, Chen Y.#, Huang S., Zhu C., Liang X., Lin F., Wei H., Zeng Z., Song J.*, Yang C.*, Well-Paired-Seq: a Size-exclusion and Locally Quasi-static Hydrodynamic Microwell Chip for Single-cell RNA-seq. Small Methods, 2022, 2200341.
10. Yin K., Zeng X., Liang X., Wei H., Zeng H., Qi W., Ruan W., Song Y., Yang C., Zhu Z.*, Crosstalk-free colloidosomes for high-throughput single-molecule protein analysis. Sci. China Chem., 2020,63, 1507–1514.
11. Yin K., Zeng X., Liu W., Xue Y., Li X., Wang W., Song Y., Zhu Z., Yang C.*, Stable Colloidosomes Formed by Self-Assembly of Colloidal Surfactant for Highly Robust Digital PCR. Anal. Chem., 2019, 91, 6003-6011.
12. Cheng R., Liang D., Xu Y., Qiu Y.,Yin K.*, Yang C.*, A Method for Multiplexed Single-Cell Transcriptome Sequencing, J. Instrum. Anal.2026, 45, 1644-1652.
13. Yin K., Xue Y., Yao T., Cheng Y., Ruan W., Ma G., An FTIR-based quality index for vegetable oil and its application in gutter oil identification. J. Instrum. Anal., 2015,34, 1291-1294.
#为第一作者，*为通讯作者
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